Isso mesmo. No Shell, que é aquela espécie de "prompt do Dos" do Linux.
Se o Linux que você utiliza entra direto no modo gráfico ao ser inicializado, é possível inserir comandos no sistema através de uma aplicação de terminal. Esse recurso é facilmente localizável em qualquer distribuição. É só procurar no menu... O prompt de comando do Linux é o Console ou o Terminal, vc o acha no menu de aplicações/Acessórios.
Atalho : pressionar simultaneamente CTRL+ALT+F1. Para retornar ao modo gráfico pressione CTRL+ALT+F7.
Se o computador que você acessa não estiver com o modo gráfico ativado, será possível digitar comandos diretamente, bastando se logar. Quando o comando é inserido, cabe ao interpretador de comandos (também conhecido como shell) executá-lo. O Linux conta com mais de um, sendo os mais conhecidos o bash e o sh.
>> Obs: Se vc está usando o Windows, para entrar no Prompt de comando é só clicar na tecla Windows (aquela que tem a bandeirinha) + R e abrir a caixinha do "Executar". Lá em Exceutar é só digitar CMD e aí abrirá a tela do prompt para digitar os coamandos.
Abraços : )