Você fazer esse tipo de pergunta, só vai ler m*e*r-da, porque quem defende o Windows vai mostrar mil motivos pra você usar Windows, e difamar o Linux, quem usa Linux, inversamente vai mostrar mil motivos pra você usar Linux e difamar o Windows.
Pontos fracos e fortes:
Windows pra começar é um Sistema Operacional PAGO, desenvolvido por vários programadores que trabalham pra Microsoft, e assim eles precisam receber por isso, então a Microsoft cobra pelo seu sistema.
O Windows é um sistema muito bom, bom mesmo, apesar de vários problemas de segurança que se apresenta, a Microsoft procura corrigi-los o mais rápido possível, mas como é o SO mais utilizado no mundo, sempre vai ter gente encontrando bug.
Hoje a maioria dos softwares, games e drivers como é de se esperar é desenvolvido para plataforma Windows.
Os contras de se utilizar o Windows, primeiro é que se você não pagar pela licença, que não é barata, você está utilizando um software pirata, e como são pessoas que trabalham pra criá-lo, isso não é legal, pois está prejudicando várias pessoas, inclusive você mesmo, pois hoje a Microsoft está barrando as atualizações que fornece automaticamente para os usuários piratas do seus sistemas.
Hoje a maioria das máquinas que vem com Windows, está vindo com a versão Windows XP Starter Edition, que possui sérias limitações, entre elas a de não poder abrir mais de 3 janelas, e de conectar um micro a sua rede local.
Softwares, como CorelDRAW, Photoshop, AutoCAD, 3D Studio não tem concorrentes a altura para plataforma Linux, ficando assim o usuário forçado a utilizar Windows.
Linux, na sua maioria de distribuições são gratuitos, você só vai pagar pelo suporte, ele é um sistema operacional muito bom, diferente se comparado ao Windows em alguns aspectos, como a Interface gráfica, que não é nativa, como no Windows, sendo necessário a utilização de uma Interface como o KDE, que como alguns usuários disseram, não permite que alguns softwares seja instalados automaticamente, necessitando de digitar senhas no Prompt do Linux, ou estando logando com o Root.
Quanto as limitações que disseram, não é assim, o Linux é um sistema bem mais aberto do que o Windows, não é acessível a usuários domésticos, mas você encontra muita coisa gratuita e sem ser pirata na Internet para Linux, até mesmo emuladores de Windows pra rodar alguns programas, como o próprio Photoshop, entretanto como são emuladores, você ainda vai precisar de uma licença desse software, como o Photoshop.
A principal vantagem do Linux, são os softwares ditos genéricos, tão bons quanto os originais do Windows que deram origens a eles, como o K3B, excelente software gratuito que substitui o Nero com enormes vantagens, entre outros, como o BrOffice que é bem superior ao MS Office, e ainda é gratuito, o Firefox do Linux não tem diferença nenhuma da versão para Windows, suportanto temas e tudo mais, enquanto no Konqueror, todas as páginas são abertas exatamente como no Internet Explorer.
Existem vários tipos de usuários de computador, se você for um usuário iniciante, e já conhece o Windows, vai ter uma certa dificuldade para se adaptar ao Linux, e se você não tem conhecimento nenhum, e é seu primeiro computador, não se influencia pagando fortunas por uma licença do Windows, pois se você está começando agora, aproveita e vá direto ao Linux, pois lhe garanto, não vai se arrepender. Pergunte a um usuário da Apple se ele quer trocar seu Mac por um PC, ninguém vai querer, e é um sistema que dizem com restrições maiores do que o próprio Linux, mas atende muito bem seus usuários.
Não acho certo os que as empresas fazem, vender um máquina com um sistema operacional, obrigando o cliente a ficar com ele ou mesmo pagar pela licença, acho que se você quiser uma máquina com SO deveria optar pela versão e pelo qual você quer no ato da compra. O fato das máquinas virem com Linux já é uma grande evolução, pois você provavelmente não vai está pagando por ele.
Se realmente for adquirir uma máquina nova, compre com qualquer Linux, menos com Windows XP Starter Edition, e depois compre uma versão do Windows, não a Starter Edition, mas quem sabe a Home, pois não é bom viver na ilegalidade, e se gostar, fique com Linux e Windows não sua máquina.